Taille : Le Mochlus Fernandi est un scinque de taille moyenne qui mesure entre 15 et 20 cm de longueur totale (queue incluse).
Apparence générale : Le corps de ce lézard est plutôt robuste et légèrement allongé, typique des membres de la famille des scinques. Il présente des écailles lisses et brillantes sur toute la surface du corps.
Couleur : La caractéristique la plus marquante du Scinque à flancs rouges est sa coloration. La face dorsale est généralement brun ou grisâtre, tandis que les flancs du corps, ainsi que la région postérieure de la tête et la base de la queue, sont marqués par de vividité de couleurs rouges ou orangées.
Queue : La queue est relativement longue, épaisse à la base, et légèrement effilée vers l'extrémité.
Membres : Les membres sont courts, adaptés à une vie plutôt terrestre, mais il est aussi capable de grimper de manière agile si nécessaire.